Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQY1

Atg12, Ubiquitin-like protein ATG12, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg12Q9CQY1 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Atg12Q9CQY1 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Atg12Q9CQY1 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms