Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQW1

Ykt6, Synaptobrevin homolog YKT6, mousemouse

Predictions only

Length 198 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ykt6Q9CQW1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Ykt6Q9CQW1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 B3galnt2-207ENSMUST00000221974 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Ykt6Q9CQW1 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Ykt6Q9CQW1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms