Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQV6

Map1lc3b, Microtubule-associated proteins 1A/1B light chain 3B, mousemouse

Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Map1lc3bQ9CQV6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Chkb-201ENSMUST00000023289 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Map1lc3bQ9CQV6 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Vwc2-201ENSMUST00000056344 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Spata2l-202ENSMUST00000166768 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Fgf11-201ENSMUST00000011285 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Gpc6-204ENSMUST00000125435 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
Map1lc3bQ9CQV6 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms