Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQP2

Trappc2, Trafficking protein particle complex subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc2Q9CQP2 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Gm37811-201ENSMUST00000192416 2601 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Gm13448-201ENSMUST00000143469 1847 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Fbxl6-201ENSMUST00000023219 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Anks1b-208ENSMUST00000182053 1649 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Tmem260-209ENSMUST00000226422 6333 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Trappc2Q9CQP2 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Hoxc9-201ENSMUST00000001706 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Trappc2Q9CQP2 Amh-201ENSMUST00000036016 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 106.2 ms