Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQM0

Nicn1, Nicolin-1, mousemouse

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nicn1Q9CQM0 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Txnrd2-201ENSMUST00000115604 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Nicn1Q9CQM0 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Nicn1Q9CQM0 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Nicn1Q9CQM0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
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Nicn1Q9CQM0 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
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Nicn1Q9CQM0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Nicn1Q9CQM0 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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