Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQL5

Mrpl18, 39S ribosomal protein L18, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 180 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl18Q9CQL5 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Abr-202ENSMUST00000072740 5394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Ccdc91-201ENSMUST00000032441 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Lyrm4-201ENSMUST00000053265 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Mrpl18Q9CQL5 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Lrrfip2-205ENSMUST00000196981 1839 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Uchl5-206ENSMUST00000189936 1696 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Tarbp2-201ENSMUST00000023813 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Mrpl18Q9CQL5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms