Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ4

Rnf2, E3 ubiquitin-protein ligase RING2, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf2Q9CQJ4 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Ppp1r21-201ENSMUST00000038551 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Hrh3-203ENSMUST00000164442 1242 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Tpst2-201ENSMUST00000031287 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Rnf2Q9CQJ4 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Alyref2-201ENSMUST00000081527 1273 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Tmed10-201ENSMUST00000040766 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Rnf2Q9CQJ4 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.9 ms