Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA6

Chchd1, Coiled-coil-helix-coiled-coil-helix domain-containing protein 1, mousemouse

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Length 118 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chchd1Q9CQA6 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Junb-201ENSMUST00000064922 1809 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Chchd1Q9CQA6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Tmem79-203ENSMUST00000107553 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Klc3-203ENSMUST00000108458 1823 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Vac14-201ENSMUST00000034190 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Chchd1Q9CQA6 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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