Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ84

Ubl4b, Ubiquitin-like protein 4B, mousemouse

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubl4bQ9CQ84 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC32.83■■■□□ 2.85
Ubl4bQ9CQ84 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ubl4bQ9CQ84 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.83■■■□□ 2.85
Ubl4bQ9CQ84 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.85
Ubl4bQ9CQ84 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC32.82■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.82■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.81■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.8■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.79■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.78■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Pacsin3-215ENSMUST00000168916 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.77■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.84
Ubl4bQ9CQ84 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC32.76■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.76■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC32.75■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Samd13-205ENSMUST00000197989 591 ntTSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.75■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.74■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC32.73■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.73■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.72■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC32.71■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.71■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC32.7■■■□□ 2.83
Ubl4bQ9CQ84 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.7■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.69■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC32.68■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC32.68■■■□□ 2.82
Ubl4bQ9CQ84 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC32.68■■■□□ 2.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms