Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ48

Nudcd2, NudC domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nudcd2Q9CQ48 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Nudcd2Q9CQ48 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Prkg2-201ENSMUST00000031277 2618 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Nudcd2Q9CQ48 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms