Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ18

Rnaseh2c, Ribonuclease H2 subunit C, mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnaseh2cQ9CQ18 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 C1qc-201ENSMUST00000046332 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp746-203ENSMUST00000203609 3648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Dnajb11-201ENSMUST00000004574 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Prkci-201ENSMUST00000108249 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp668-202ENSMUST00000106261 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rnaseh2cQ9CQ18 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rnaseh2cQ9CQ18 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
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Rnaseh2cQ9CQ18 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Kcnn4-201ENSMUST00000171904 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Rnaseh2cQ9CQ18 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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