Protein–RNA interactions for Protein: Q99PL6

Ubxn6, UBX domain-containing protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn6Q99PL6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Wdr37-203ENSMUST00000164183 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Ubxn6Q99PL6 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Tmbim1-201ENSMUST00000016309 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Bmpr1b-203ENSMUST00000106230 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Zmynd10-201ENSMUST00000010188 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Miga1-201ENSMUST00000068243 2689 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Fzr1-205ENSMUST00000140901 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Cct4-201ENSMUST00000020562 1634 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Ubxn6Q99PL6 Chst7-201ENSMUST00000044138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Ubxn6Q99PL6 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms