Protein–RNA interactions for Protein: Q99N20

Brms1, Breast cancer metastasis-suppressor 1 homolog, mousemouse

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Length 246 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brms1Q99N20 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
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Brms1Q99N20 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Brms1Q99N20 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.04
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Brms1Q99N20 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
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Brms1Q99N20 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Brms1Q99N20 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
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Brms1Q99N20 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
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Brms1Q99N20 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
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Brms1Q99N20 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Brms1Q99N20 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
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