Protein–RNA interactions for Protein: Q99N05

Ms4a4d, Membrane-spanning 4-domains subfamily A member 4D, mousemouse

Predictions only

Length 225 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ms4a4dQ99N05 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 E130307A14Rik-202ENSMUST00000133302 438 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Ms4a4dQ99N05 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms