Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR6

Srrt, Serrate RNA effector molecule homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 875 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SrrtQ99MR6 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 1700028E10Rik-201ENSMUST00000181114 2034 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Mchr1-201ENSMUST00000166855 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Dyrk1b-203ENSMUST00000172761 2018 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Pgam5-202ENSMUST00000112505 2098 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SrrtQ99MR6 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Nubp1-201ENSMUST00000023146 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Ankrd9-207ENSMUST00000148765 1431 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Ripk2-201ENSMUST00000037035 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Cd82-201ENSMUST00000028644 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Igsf8-202ENSMUST00000085912 2182 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SrrtQ99MR6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.1 ms