Protein–RNA interactions for Protein: Q99ML1

Bbc3, Bcl-2-binding component 3, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bbc3Q99ML1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bbc3Q99ML1 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bbc3Q99ML1 Plekhm2-201ENSMUST00000030751 4154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bbc3Q99ML1 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Bbc3Q99ML1 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbc3Q99ML1 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbc3Q99ML1 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbc3Q99ML1 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbc3Q99ML1 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbc3Q99ML1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbc3Q99ML1 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbc3Q99ML1 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbc3Q99ML1 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbc3Q99ML1 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbc3Q99ML1 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Bbc3Q99ML1 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 6330403K07Rik-201ENSMUST00000156068 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Ints6-201ENSMUST00000053959 4993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Bbc3Q99ML1 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbc3Q99ML1 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbc3Q99ML1 Zfp644-204ENSMUST00000112696 5785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbc3Q99ML1 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Bbc3Q99ML1 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbc3Q99ML1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Bbc3Q99ML1 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms