Protein–RNA interactions for Protein: Q99LI7

Cstf3, Cleavage stimulation factor subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cstf3Q99LI7 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Nat14-201ENSMUST00000047309 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Cstf3Q99LI7 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Cstf3Q99LI7 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms