Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG4

Ttc5, Tetratricopeptide repeat protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc5Q99LG4 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc5Q99LG4 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc5Q99LG4 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc5Q99LG4 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc5Q99LG4 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc5Q99LG4 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc5Q99LG4 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc5Q99LG4 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ttc5Q99LG4 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc5Q99LG4 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc5Q99LG4 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc5Q99LG4 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc5Q99LG4 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc5Q99LG4 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc5Q99LG4 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc5Q99LG4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc5Q99LG4 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ttc5Q99LG4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Ssbp2-202ENSMUST00000042122 1633 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Polg2-201ENSMUST00000021060 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ttc5Q99LG4 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Ttc5Q99LG4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc5Q99LG4 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc5Q99LG4 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc5Q99LG4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc5Q99LG4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ttc5Q99LG4 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc5Q99LG4 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc5Q99LG4 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ttc5Q99LG4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms