Protein–RNA interactions for Protein: Q99LG0

Usp16, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 16, mousemouse

Predictions only

Length 825 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp16Q99LG0 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Disc1-204ENSMUST00000115885 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Disc1-202ENSMUST00000075730 2408 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Usp16Q99LG0 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Cirbp-202ENSMUST00000105365 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Htr7-201ENSMUST00000099505 1606 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 1700081N11Rik-202ENSMUST00000221447 569 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Usp16Q99LG0 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Cdc37l1-205ENSMUST00000224599 1769 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Capzb-204ENSMUST00000102508 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Fbxw2-206ENSMUST00000113080 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Usp16Q99LG0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.7 ms