Protein–RNA interactions for Protein: Q99LF4

Rtcb, tRNA-splicing ligase RtcB homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RtcbQ99LF4 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
RtcbQ99LF4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
RtcbQ99LF4 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Chpt1-202ENSMUST00000073783 852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
RtcbQ99LF4 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.8 ms