Protein–RNA interactions for Protein: Q99KP6

Prpf19, Pre-mRNA-processing factor 19, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 504 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf19Q99KP6 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Cpne7-201ENSMUST00000037900 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Nudt10-201ENSMUST00000103006 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Wnk2-211ENSMUST00000162581 6628 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Coq10b-201ENSMUST00000027125 1733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Cuta-201ENSMUST00000025027 639 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Rabgap1l-201ENSMUST00000028049 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Prpf19Q99KP6 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Zdhhc13-201ENSMUST00000118927 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Gm37352-201ENSMUST00000193908 2181 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Txnrd2-203ENSMUST00000115606 1905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Galnt14-202ENSMUST00000112591 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Vrk1-202ENSMUST00000072040 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Snrnp70-201ENSMUST00000074575 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Prpf19Q99KP6 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 58.4 ms