Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Nfe2-201ENSMUST00000075192 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Stx1a-201ENSMUST00000005509 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Ciao1Q99KN2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Qpct-201ENSMUST00000040789 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Slc35a2-203ENSMUST00000115663 1527 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 C230062I16Rik-202ENSMUST00000207746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Ciao1Q99KN2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ciao1Q99KN2 Zfp444-203ENSMUST00000108566 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms