Protein–RNA interactions for Protein: Q99KJ8

Dctn2, Dynactin subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 402 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dctn2Q99KJ8 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Setd6-201ENSMUST00000034096 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Aatf-201ENSMUST00000018841 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Leng1-201ENSMUST00000019878 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Yipf2-203ENSMUST00000180365 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Dctn2Q99KJ8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Cnot11-201ENSMUST00000003219 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Fem1c-201ENSMUST00000036226 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Slc39a5-201ENSMUST00000042666 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Rpap3-201ENSMUST00000023104 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Dctn2Q99KJ8 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms