Protein–RNA interactions for Protein: Q99KF1

Tmed9, Transmembrane emp24 domain-containing protein 9, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmed9Q99KF1 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Dgke-202ENSMUST00000107894 8347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Tmed9Q99KF1 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Dcun1d1-201ENSMUST00000108182 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Gm6627-201ENSMUST00000218299 2386 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Ahr-202ENSMUST00000116436 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Tmem131-201ENSMUST00000027290 6546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Tmed9Q99KF1 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
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