Protein–RNA interactions for Protein: Q99K51

Pls3, Plastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pls3Q99K51 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC21.13■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Gm27027-201ENSMUST00000183110 547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Rpl13-201ENSMUST00000000756 780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Ngb-203ENSMUST00000110177 1611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Hpca-201ENSMUST00000030572 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Maz-203ENSMUST00000205568 2650 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Cbfb-201ENSMUST00000052209 2883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Dusp14-202ENSMUST00000100705 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Pls3Q99K51 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Pls3Q99K51 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.7 ms