Protein–RNA interactions for Protein: Q99K46

Usp11, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 11, mousemouse

Predictions only

Length 921 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp11Q99K46 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Usp11Q99K46 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Siglecf-206ENSMUST00000206299 2149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Mgat4b-201ENSMUST00000041725 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Nudt19-201ENSMUST00000040962 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Usp11Q99K46 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.7 ms