Protein–RNA interactions for Protein: Q99J21

Mcoln1, Mucolipin-1, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mcoln1Q99J21 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Mapre3-202ENSMUST00000200692 1816 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Fxyd5-208ENSMUST00000161805 1166 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Mcoln1Q99J21 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Hmx2-202ENSMUST00000183219 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Golga7-201ENSMUST00000051094 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Gm10231-201ENSMUST00000181584 441 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Atp5g2-202ENSMUST00000185641 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Gm10175-202ENSMUST00000208752 441 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Atp5g2-201ENSMUST00000075630 441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Mcoln1Q99J21 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms