Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Gm43231-201ENSMUST00000202960 2258 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Dennd2a-201ENSMUST00000036877 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Lrfn4-202ENSMUST00000113822 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
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Smim11aQ99J19 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
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Smim11aQ99J19 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
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Smim11aQ99J19 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
Smim11aQ99J19 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
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Smim11aQ99J19 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Srp68-201ENSMUST00000021133 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Tmem222-201ENSMUST00000105907 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
Smim11aQ99J19 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
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