Protein–RNA interactions for Protein: Q99J10

Ctu1, Cytoplasmic tRNA 2-thiolation protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctu1Q99J10 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Rchy1-204ENSMUST00000169948 1417 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ctu1Q99J10 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Snapc2-201ENSMUST00000011981 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Schip1-206ENSMUST00000182719 2156 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Gm6802-201ENSMUST00000167843 1983 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Ctu1Q99J10 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Scn1b-203ENSMUST00000211945 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Ctu1Q99J10 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms