Protein–RNA interactions for Protein: Q925N4

Cldn16, Claudin-16, mousemouse

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Length 235 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn16Q925N4 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Gpn2-202ENSMUST00000105899 996 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Scrib-203ENSMUST00000109946 5545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Dact3-201ENSMUST00000108493 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Daxx-202ENSMUST00000170075 2673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 AA386476-201ENSMUST00000098781 1665 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Cldn16Q925N4 Hnrnpul2-201ENSMUST00000096753 5726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Cpeb3-202ENSMUST00000123727 2411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Cyp2r1-207ENSMUST00000211506 1887 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Ltbr-201ENSMUST00000032489 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Cldn16Q925N4 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
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