Protein–RNA interactions for Protein: Q925I7

Pdgfd, Platelet-derived growth factor D, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PdgfdQ925I7 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
PdgfdQ925I7 Gm10167-201ENSMUST00000150411 1479 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 2200002D01Rik-201ENSMUST00000032808 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Dcxr-201ENSMUST00000026144 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Unc50-201ENSMUST00000027285 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Btg1-202ENSMUST00000218953 668 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
PdgfdQ925I7 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Gm26643-201ENSMUST00000180854 1274 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Vti1b-201ENSMUST00000055262 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
PdgfdQ925I7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms