Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Foxp1-220ENSMUST00000176565 3727 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Asxl1-201ENSMUST00000109790 6968 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Cradd-205ENSMUST00000220279 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Dido1-202ENSMUST00000087517 8723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Dip2b-202ENSMUST00000100203 8914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Xkr4-201ENSMUST00000070533 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Pacs1-201ENSMUST00000025786 4339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Dennd5b-201ENSMUST00000111557 9831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Gas2-203ENSMUST00000107591 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Pcdh20-201ENSMUST00000061628 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Arhgap26-201ENSMUST00000097593 7898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Eif4h-205ENSMUST00000202622 2726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Tbc1d30-201ENSMUST00000064107 5695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Ddx41-201ENSMUST00000021956 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Ino80-201ENSMUST00000049920 6354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Wdsub1-201ENSMUST00000028368 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Uba5-201ENSMUST00000035166 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Grin3a-202ENSMUST00000093859 7491 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Myh14-202ENSMUST00000107899 6390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Fbxo41-203ENSMUST00000161546 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC11.03□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Dnajc1-202ENSMUST00000091418 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Pcdha11-202ENSMUST00000115657 5360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Lingo1-203ENSMUST00000114256 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
SptssbQ925E8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms