Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Atf5-202ENSMUST00000107893 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 H2afx-201ENSMUST00000052686 1384 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Gm28523-201ENSMUST00000190040 1588 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Coq9-201ENSMUST00000034234 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Sf3b3Q921M3 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 1810059H22Rik-205ENSMUST00000204570 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Gm45890-201ENSMUST00000212043 1026 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Rpl21-203ENSMUST00000099272 1067 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 AC135637.1-201ENSMUST00000227750 365 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Slc35f4-201ENSMUST00000074368 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Gm30003-201ENSMUST00000200700 1433 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Sf3b3Q921M3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Sf3b3Q921M3 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms