Protein–RNA interactions for Protein: Q920F6

Smc1b, Structural maintenance of chromosomes protein 1B, mousemouse

Predictions only

Length 1,248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1bQ920F6 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 9130213A22Rik-201ENSMUST00000180487 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 1700030C10Rik-203ENSMUST00000189625 1735 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Smc1bQ920F6 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Cops7a-201ENSMUST00000032220 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Gm10612-201ENSMUST00000162198 1681 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Camk2b-201ENSMUST00000002817 1872 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Smc1bQ920F6 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Fgfbp3-201ENSMUST00000057337 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Smc1bQ920F6 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms