Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Wnt10a-201ENSMUST00000006718 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Crhr1-201ENSMUST00000093925 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Ulk2-201ENSMUST00000004920 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Atoh8-201ENSMUST00000042646 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
Snx4Q91YJ2 Gclm-206ENSMUST00000178826 1002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Uck1-201ENSMUST00000002625 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Snx4Q91YJ2 Shisa7-203ENSMUST00000119433 3481 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms