Protein–RNA interactions for Protein: Q91X60

Chrna2, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-2, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chrna2Q91X60 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Gm18377-201ENSMUST00000215141 607 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Rnase9-201ENSMUST00000064214 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Gemin6-201ENSMUST00000069486 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Rbfox3-204ENSMUST00000106278 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Gm12439-201ENSMUST00000117162 365 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Mrps18a-202ENSMUST00000123646 621 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Gm16275-201ENSMUST00000147774 712 ntTSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 AC153912.1-201ENSMUST00000217011 724 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 U2af1-201ENSMUST00000014684 907 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 U2af1-202ENSMUST00000166526 907 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Chrna2Q91X60 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Gm5083-202ENSMUST00000163056 1204 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Gm42626-201ENSMUST00000196866 1148 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Gm43553-201ENSMUST00000200900 685 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Gm29644-201ENSMUST00000189003 1341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Vmn1r34-201ENSMUST00000074381 930 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Gm10271-201ENSMUST00000092165 156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Chrna2Q91X60 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Chrna2Q91X60 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18 ms