Protein–RNA interactions for Protein: Q91WD4

UPF0415 protein C7orf25 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 421 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q91WD4 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q91WD4 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q91WD4 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q91WD4 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q91WD4 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q91WD4 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q91WD4 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Q91WD4 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q91WD4 Metap1-201ENSMUST00000029804 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q91WD4 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q91WD4 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q91WD4 AC124603.1-201ENSMUST00000223843 308 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Q91WD4 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q91WD4 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q91WD4 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q91WD4 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q91WD4 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q91WD4 Olfm2-204ENSMUST00000217198 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Q91WD4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q91WD4 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q91WD4 Sphk1-203ENSMUST00000100201 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q91WD4 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Q91WD4 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q91WD4 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q91WD4 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q91WD4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q91WD4 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q91WD4 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q91WD4 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q91WD4 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Q91WD4 Donson-202ENSMUST00000114031 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q91WD4 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q91WD4 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q91WD4 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q91WD4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q91WD4 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q91WD4 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q91WD4 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q91WD4 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q91WD4 Eif2b4-212ENSMUST00000202758 1767 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q91WD4 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Q91WD4 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q91WD4 Gm44731-201ENSMUST00000203086 542 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q91WD4 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q91WD4 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q91WD4 Them6-201ENSMUST00000070923 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q91WD4 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q91WD4 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Q91WD4 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Q91WD4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q91WD4 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q91WD4 Hoxa10-202ENSMUST00000125581 2565 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Q91WD4 Gm5577-201ENSMUST00000134600 1434 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q91WD4 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
Q91WD4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q91WD4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q91WD4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q91WD4 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q91WD4 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q91WD4 E030030I06Rik-202ENSMUST00000179054 2081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q91WD4 Cdk4-201ENSMUST00000006911 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q91WD4 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Q91WD4 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q91WD4 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q91WD4 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q91WD4 Slc11a1-211ENSMUST00000187516 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q91WD4 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q91WD4 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q91WD4 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q91WD4 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q91WD4 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q91WD4 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Q91WD4 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q91WD4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q91WD4 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q91WD4 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q91WD4 Dhx15-205ENSMUST00000199321 2550 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q91WD4 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q91WD4 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q91WD4 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Q91WD4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q91WD4 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q91WD4 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q91WD4 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q91WD4 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Q91WD4 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q91WD4 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q91WD4 Gmpr-201ENSMUST00000000260 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q91WD4 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q91WD4 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Q91WD4 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q91WD4 Nags-201ENSMUST00000055409 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q91WD4 Matk-204ENSMUST00000120265 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q91WD4 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q91WD4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q91WD4 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q91WD4 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q91WD4 Runx2-210ENSMUST00000162373 1565 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Q91WD4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Q91WD4 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms