Protein–RNA interactions for Protein: Q91W40

Klc3, Kinesin light chain 3, mousemouse

Predictions only

Length 508 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klc3Q91W40 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Rcl1-201ENSMUST00000064393 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Zfp580-201ENSMUST00000069324 1096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Klc3Q91W40 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Gpatch2-201ENSMUST00000044812 1639 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Capzb-203ENSMUST00000102507 1702 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Runx1-203ENSMUST00000168195 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Klc3Q91W40 Bnip1-201ENSMUST00000015725 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Smyd2-201ENSMUST00000027897 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Slc35f4-204ENSMUST00000138884 1810 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Esx1-202ENSMUST00000113066 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Klc3Q91W40 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.4 ms