Protein–RNA interactions for Protein: Q91W36

Usp3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp3Q91W36 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
Usp3Q91W36 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Gm38165-201ENSMUST00000191654 486 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Dxo-201ENSMUST00000046244 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Kcnd3os-201ENSMUST00000130683 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Pthlh-201ENSMUST00000052296 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 AV026068-204ENSMUST00000186214 633 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Gm18671-201ENSMUST00000214826 683 ntBASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Usp3Q91W36 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp3Q91W36 Sra1-201ENSMUST00000001415 2061 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp3Q91W36 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp3Q91W36 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp3Q91W36 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp3Q91W36 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Usp3Q91W36 Prmt8-201ENSMUST00000032500 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp3Q91W36 Pllp-201ENSMUST00000034227 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp3Q91W36 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp3Q91W36 Ildr2-204ENSMUST00000192732 2263 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp3Q91W36 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp3Q91W36 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp3Q91W36 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp3Q91W36 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp3Q91W36 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp3Q91W36 AV356131-201ENSMUST00000206201 750 ntBASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp3Q91W36 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Usp3Q91W36 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms