Protein–RNA interactions for Protein: Q91V80

Apof, Apolipoprotein F, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApofQ91V80 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApofQ91V80 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApofQ91V80 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApofQ91V80 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApofQ91V80 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
ApofQ91V80 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApofQ91V80 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApofQ91V80 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApofQ91V80 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
ApofQ91V80 D830050J10Rik-202ENSMUST00000203858 1813 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Gpr3-201ENSMUST00000052090 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Mrps16-201ENSMUST00000061444 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Nfix-201ENSMUST00000076715 1403 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 March11-202ENSMUST00000140840 1558 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Pacsin2-201ENSMUST00000056177 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Mpg-201ENSMUST00000020528 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Gm16505-202ENSMUST00000220976 1626 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Emc9-201ENSMUST00000022828 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Sstr4-201ENSMUST00000109962 1424 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ApofQ91V80 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ApofQ91V80 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ApofQ91V80 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ApofQ91V80 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ApofQ91V80 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ApofQ91V80 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ApofQ91V80 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ApofQ91V80 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ApofQ91V80 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApofQ91V80 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApofQ91V80 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApofQ91V80 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApofQ91V80 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApofQ91V80 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApofQ91V80 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ApofQ91V80 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.8 ms