Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHW4

Cacng5, Voltage-dependent calcium channel gamma-5 subunit, mousemouse

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacng5Q8VHW4 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Tcp11-201ENSMUST00000042692 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Trim72-201ENSMUST00000081042 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Psmd11-214ENSMUST00000173938 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Snx4-201ENSMUST00000023502 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Tnrc18-201ENSMUST00000151477 6487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Arpc5-202ENSMUST00000097536 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Cacng5Q8VHW4 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Blcap-202ENSMUST00000109528 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Cacng5Q8VHW4 1700016K19Rik-201ENSMUST00000066408 921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms