Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEE0

Rpe, Ribulose-phosphate 3-epimerase, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RpeQ8VEE0 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Meis3-201ENSMUST00000002495 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Gm16933-201ENSMUST00000141741 2169 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Srxn1-201ENSMUST00000041500 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
RpeQ8VEE0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Tmem250-ps-201ENSMUST00000133808 2483 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Vstm2b-201ENSMUST00000044705 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Fbxo22-204ENSMUST00000146201 2009 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Hes1-201ENSMUST00000023171 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 1700007K13Rik-201ENSMUST00000086370 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Gm27454-201ENSMUST00000185090 204 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
RpeQ8VEE0 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms