Protein–RNA interactions for Protein: Q8VED5

Krt79, Keratin, type II cytoskeletal 79, mousemouse

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Length 531 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt79Q8VED5 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Krt79Q8VED5 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt79Q8VED5 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt79Q8VED5 St3gal4-201ENSMUST00000034537 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt79Q8VED5 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt79Q8VED5 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt79Q8VED5 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt79Q8VED5 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt79Q8VED5 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt79Q8VED5 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt79Q8VED5 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Krt79Q8VED5 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt79Q8VED5 Jsrp1-203ENSMUST00000181039 1108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt79Q8VED5 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt79Q8VED5 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt79Q8VED5 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Krt79Q8VED5 AB124611-202ENSMUST00000086361 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Mall-201ENSMUST00000028856 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Fam58b-201ENSMUST00000059468 1224 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Sqstm1-202ENSMUST00000102774 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Brpf3-201ENSMUST00000004985 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Gm45640-201ENSMUST00000210665 1896 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Cldn23-201ENSMUST00000060128 1848 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Akt1s1-203ENSMUST00000107882 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 4930539J05Rik-202ENSMUST00000182865 511 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Plin1-202ENSMUST00000178257 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Hyal2-207ENSMUST00000195752 2062 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Krt79Q8VED5 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Kis2-201ENSMUST00000133214 1717 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Fblim1-202ENSMUST00000105784 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Rin3-202ENSMUST00000101114 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Gm32699-201ENSMUST00000221728 1988 ntBASIC21.45■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Wnt8a-201ENSMUST00000012426 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Zfp580-202ENSMUST00000208570 693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Krt79Q8VED5 Alg9-201ENSMUST00000034561 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms