Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDQ1

Ptgr2, Prostaglandin reductase 2, mousemouse

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Length 351 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ptgr2Q8VDQ1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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Ptgr2Q8VDQ1 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptgr2Q8VDQ1 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Ptgr2Q8VDQ1 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
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Ptgr2Q8VDQ1 Fxr2-201ENSMUST00000018909 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
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Ptgr2Q8VDQ1 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptgr2Q8VDQ1 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptgr2Q8VDQ1 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptgr2Q8VDQ1 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptgr2Q8VDQ1 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptgr2Q8VDQ1 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptgr2Q8VDQ1 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptgr2Q8VDQ1 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptgr2Q8VDQ1 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Ptgr2Q8VDQ1 Polr1d-202ENSMUST00000110557 1137 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptgr2Q8VDQ1 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptgr2Q8VDQ1 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptgr2Q8VDQ1 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Ptgr2Q8VDQ1 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms