Protein–RNA interactions for Protein: Q8VD37

Sgip1, SH3-containing GRB2-like protein 3-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 806 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sgip1Q8VD37 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Tradd-201ENSMUST00000034359 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 1700065D16Rik-204ENSMUST00000189348 1540 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Matk-205ENSMUST00000121205 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 5830487J09Rik-201ENSMUST00000198600 1256 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Sgip1Q8VD37 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Atg101-201ENSMUST00000048393 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Gfer-201ENSMUST00000046839 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Arid3c-204ENSMUST00000171251 1751 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 3010003L21Rik-201ENSMUST00000047953 1729 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Gm31727-201ENSMUST00000210102 360 ntTSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Sgip1Q8VD37 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC23.08■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Gm27032-201ENSMUST00000183124 1116 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Psenen-201ENSMUST00000043898 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Sgip1Q8VD37 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms