Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCH8

Ubxn4, UBX domain-containing protein 4, mousemouse

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Length 506 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ubxn4Q8VCH8 Hs3st5-202ENSMUST00000167191 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Ciapin1-201ENSMUST00000034233 1807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Chd3os-201ENSMUST00000129321 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Egln1-201ENSMUST00000034469 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 3110082J24Rik-202ENSMUST00000199573 767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Arhgap44-202ENSMUST00000093001 2256 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Lrrc43-203ENSMUST00000196809 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Mpp6-201ENSMUST00000036225 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 R3hdm4-201ENSMUST00000045628 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Gng12-202ENSMUST00000114222 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Plekhm2-202ENSMUST00000084203 4136 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Ubxn4Q8VCH8 1810055G02Rik-201ENSMUST00000039048 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Kcnq2-203ENSMUST00000081528 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm18688-201ENSMUST00000204695 1859 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Mycl-202ENSMUST00000106252 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Ech1-201ENSMUST00000066264 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 St3gal3-201ENSMUST00000030263 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Azi2-205ENSMUST00000133580 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Lpcat2-205ENSMUST00000210099 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Rhod-201ENSMUST00000048197 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Crlf2-203ENSMUST00000200284 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Ubxn4Q8VCH8 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms