Protein–RNA interactions for Protein: Q8VC88

Gca, Grancalcin, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GcaQ8VC88 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Map4k5-203ENSMUST00000110570 4498 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Adgra2-201ENSMUST00000033876 5760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Plin1-201ENSMUST00000032762 1916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Sept7-201ENSMUST00000115272 2533 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Maff-202ENSMUST00000163691 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Kiz-201ENSMUST00000099278 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Farp1-201ENSMUST00000026635 4885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Lrrfip1-201ENSMUST00000068116 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Klhdc3-202ENSMUST00000165007 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Krt77-201ENSMUST00000087996 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
GcaQ8VC88 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Satb1-211ENSMUST00000152830 5993 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Tnfsf11-201ENSMUST00000022592 2236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Irx3-201ENSMUST00000093312 2610 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Cacfd1-202ENSMUST00000114004 2194 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 C630004M23Rik-201ENSMUST00000194765 1682 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 BC021767-201ENSMUST00000126387 1716 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
GcaQ8VC88 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms