Protein–RNA interactions for Protein: Q8R2Q0

Trim29, Tripartite motif-containing protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim29Q8R2Q0 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Cyp4f13-201ENSMUST00000075253 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Ss18l2-201ENSMUST00000035113 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim29Q8R2Q0 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Gm11691-201ENSMUST00000130963 658 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Wipi2-202ENSMUST00000110778 1959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 AC165080.2-201ENSMUST00000217491 1530 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Sox8-202ENSMUST00000173447 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Map3k9-201ENSMUST00000035987 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 5033417F24Rik-201ENSMUST00000181575 1787 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Nlgn2-202ENSMUST00000108634 5568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Naglu-201ENSMUST00000001802 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Lypla2-202ENSMUST00000105852 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Trim29Q8R2Q0 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Foxa2-201ENSMUST00000047315 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Rcor3-203ENSMUST00000192128 1578 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Ttc39a-203ENSMUST00000106619 1778 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Gm13830-204ENSMUST00000149609 1851 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Gtsf1-201ENSMUST00000023129 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Zfp771-201ENSMUST00000052509 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim29Q8R2Q0 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms