Protein–RNA interactions for Protein: Q8R107

Prelid1, PRELI domain-containing protein 1, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid1Q8R107 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 Samd4-211ENSMUST00000228404 3039 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 Syt3-203ENSMUST00000120262 2096 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 Thoc3-201ENSMUST00000026990 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Prelid1Q8R107 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Gtf2e2-202ENSMUST00000170705 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Tfap2c-201ENSMUST00000030391 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Six1-201ENSMUST00000050029 3316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Usp21-201ENSMUST00000065941 2219 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Stoml1-201ENSMUST00000034883 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Cyb5d2-201ENSMUST00000079681 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Prelid1Q8R107 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 117.8 ms