Protein–RNA interactions for Protein: Q8QZZ7

Tprkb, EKC/KEOPS complex subunit Tprkb, mousemouse

Predictions only

Length 175 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TprkbQ8QZZ7 Gm12524-201ENSMUST00000143109 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Pcf11-201ENSMUST00000119954 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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TprkbQ8QZZ7 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 D5Ertd579e-204ENSMUST00000140653 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Cd24a-201ENSMUST00000058714 1816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Cnih2-201ENSMUST00000025805 1237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Ascl4-202ENSMUST00000170396 2016 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
TprkbQ8QZZ7 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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TprkbQ8QZZ7 6430500D05Rik-201ENSMUST00000198286 1176 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Twist2-202ENSMUST00000186075 2525 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
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TprkbQ8QZZ7 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Zfp710-204ENSMUST00000206039 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TprkbQ8QZZ7 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TprkbQ8QZZ7 Fkbp1a-201ENSMUST00000044011 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
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TprkbQ8QZZ7 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Fbxo27-203ENSMUST00000108281 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 6820408C15Rik-201ENSMUST00000039961 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Pigt-202ENSMUST00000117066 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Eefsec-206ENSMUST00000205179 2208 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 AC154266.1-201ENSMUST00000223190 503 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Pianp-201ENSMUST00000032479 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
TprkbQ8QZZ7 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
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